MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EDL933 chromosome

Total Repeats: 99721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002655	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15799681
2	NC_002655	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15799681
3	NC_002655	CAC	3	9	225	233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15799681
4	NC_002655	ACCATT	2	12	238	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799681
5	NC_002655	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799682
6	NC_002655	CAGG	2	8	437	444	25 %	0 %	50 %	25 %	15799682
7	NC_002655	CT	3	6	462	467	0 %	50 %	0 %	50 %	15799682
8	NC_002655	ACCA	2	8	483	490	50 %	0 %	0 %	50 %	15799682
9	NC_002655	TGG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799682
10	NC_002655	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
11	NC_002655	A	6	6	508	513	100 %	0 %	0 %	0 %	15799682
12	NC_002655	CGC	3	9	587	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799682
13	NC_002655	TCG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
14	NC_002655	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	15799682
15	NC_002655	GC	3	6	771	776	0 %	0 %	50 %	50 %	15799682
16	NC_002655	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
17	NC_002655	CCG	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799682
18	NC_002655	CCG	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799682
19	NC_002655	TGG	2	6	949	954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799682
20	NC_002655	ACT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799682
21	NC_002655	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799682
22	NC_002655	GCTG	2	8	992	999	0 %	25 %	50 %	25 %	15799682
23	NC_002655	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799682
24	NC_002655	GGAC	2	8	1030	1037	25 %	0 %	50 %	25 %	15799682
25	NC_002655	TA	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	15799682
26	NC_002655	GTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799682
27	NC_002655	TTC	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15799682
28	NC_002655	TGA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
29	NC_002655	AAT	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15799682
30	NC_002655	GGC	2	6	1346	1351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799682
31	NC_002655	GC	3	6	1350	1355	0 %	0 %	50 %	50 %	15799682
32	NC_002655	TGC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
33	NC_002655	GTG	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799682
34	NC_002655	ATC	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799682
35	NC_002655	TG	3	6	1452	1457	0 %	50 %	50 %	0 %	15799682
36	NC_002655	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799682
37	NC_002655	GGT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799682
38	NC_002655	TCT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15799682
39	NC_002655	GAT	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
40	NC_002655	TCA	2	6	1718	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799682
41	NC_002655	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
42	NC_002655	GAA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799682
43	NC_002655	GAA	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799682
44	NC_002655	ATC	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799682
45	NC_002655	TTG	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799682
46	NC_002655	CCAG	2	8	2020	2027	25 %	0 %	25 %	50 %	15799682
47	NC_002655	TCG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
48	NC_002655	TAC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799682
49	NC_002655	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
50	NC_002655	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
51	NC_002655	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
52	NC_002655	ATTGAA	2	12	2448	2459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15799682
53	NC_002655	TGC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
54	NC_002655	CGA	2	6	2528	2533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15799682
55	NC_002655	CG	4	8	2543	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	15799682
56	NC_002655	TGA	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
57	NC_002655	TGA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799682
58	NC_002655	TAT	2	6	2703	2708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15799682
59	NC_002655	TGC	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799682
60	NC_002655	GCG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799683
61	NC_002655	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15799683
62	NC_002655	GCAA	2	8	3047	3054	50 %	0 %	25 %	25 %	15799683
63	NC_002655	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799683
64	NC_002655	ATGA	2	8	3145	3152	50 %	25 %	25 %	0 %	15799683
65	NC_002655	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15799683
66	NC_002655	TGG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799683
67	NC_002655	TGA	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799683
68	NC_002655	GAA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799683
69	NC_002655	CAT	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799683
70	NC_002655	CAGC	2	8	3300	3307	25 %	0 %	25 %	50 %	15799683
71	NC_002655	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799683
72	NC_002655	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799683
73	NC_002655	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	15799683
74	NC_002655	TTCA	2	8	3445	3452	25 %	50 %	0 %	25 %	15799683
75	NC_002655	TGA	2	6	3491	3496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799683
76	NC_002655	AGCG	2	8	3582	3589	25 %	0 %	50 %	25 %	15799683
77	NC_002655	TCCGGC	2	12	3595	3606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15799683
78	NC_002655	TG	3	6	3623	3628	0 %	50 %	50 %	0 %	15799683
79	NC_002655	CGG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799683
80	NC_002655	T	6	6	3838	3843	0 %	100 %	0 %	0 %	15799684
81	NC_002655	CTGA	2	8	3868	3875	25 %	25 %	25 %	25 %	15799684
82	NC_002655	TGA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799684
83	NC_002655	TGA	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799684
84	NC_002655	GC	3	6	3978	3983	0 %	0 %	50 %	50 %	15799684
85	NC_002655	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799684
86	NC_002655	GGC	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799684
87	NC_002655	TGA	3	9	4341	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799684
88	NC_002655	CTA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799684
89	NC_002655	GC	3	6	4459	4464	0 %	0 %	50 %	50 %	15799684
90	NC_002655	CGG	2	6	4511	4516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799684
91	NC_002655	CTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799684
92	NC_002655	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799684
93	NC_002655	AAC	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15799684
94	NC_002655	GTT	2	6	4692	4697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799684
95	NC_002655	CCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799684
96	NC_002655	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799684
97	NC_002655	GAT	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799684
98	NC_002655	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	15799684
99	NC_002655	CCG	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799684
100	NC_002655	TGC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799684
101	NC_002655	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799684
102	NC_002655	ATC	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799684
103	NC_002655	TTA	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15799685
104	NC_002655	TGG	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799685
105	NC_002655	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15799685
106	NC_002655	CCG	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799685
107	NC_002655	CCG	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799685
108	NC_002655	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799685
109	NC_002655	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799685
110	NC_002655	CGG	2	6	5514	5519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799685
111	NC_002655	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799686
112	NC_002655	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15799686
113	NC_002655	TCA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799686
114	NC_002655	AAG	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799686
115	NC_002655	CAGT	2	8	5783	5790	25 %	25 %	25 %	25 %	15799686
116	NC_002655	AAT	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15799686
117	NC_002655	TCA	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799686
118	NC_002655	TTC	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15799686
119	NC_002655	TTC	2	6	5929	5934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15799686
120	NC_002655	CAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15799686
121	NC_002655	TGC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799686
122	NC_002655	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799686
123	NC_002655	TGA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15799686
124	NC_002655	GCGG	2	8	6116	6123	0 %	0 %	75 %	25 %	15799686
125	NC_002655	AAATCG	2	12	6169	6180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15799686
126	NC_002655	AGCG	2	8	6287	6294	25 %	0 %	50 %	25 %	15799686
127	NC_002655	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15799686
128	NC_002655	GTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15799686
129	NC_002655	CAT	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799687
130	NC_002655	GCC	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799687
131	NC_002655	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15799687
132	NC_002655	AGA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799687
133	NC_002655	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15799687
134	NC_002655	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799687
135	NC_002655	TGCCGC	2	12	7125	7136	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15799687
136	NC_002655	CGC	2	6	7221	7226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799687
137	NC_002655	GCC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15799687
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139	NC_002655	TTA	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15799687
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143	NC_002655	CGG	2	6	7718	7723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799687
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152	NC_002655	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	15799688
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154	NC_002655	CAG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15799688
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156	NC_002655	CAG	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15799688
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162	NC_002655	AGA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15799688
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267	NC_002655	GGC	2	6	14491	14496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15799695
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